初期雨水和清洁雨水的主要区别体现在它们的来源、成分以及对环境的影响等方面。

首先，从来源上看，初期雨水是降雨初期的雨水，特指地面10~15mm厚已形成地表径流的降水。这部分雨水在降落的初期，溶解了空气中的大量酸性气体、汽车尾气、工厂废气等污染性气体，并且冲刷屋面、沥青混凝土道路等，导致其中含有大量的污染物质，污染程度较高。而清洁雨水则是指相对较为纯净的雨水，其源头主要来自海洋、湖泊、河流以及植被的蒸腾作用，没有经过地面和水体的复杂循环过程，不含有大量的杂质和污染物。

其次，从成分上看，初期雨水由于含有大量的污染物质，如重金属、有机物、油脂等，其水质较差，甚至可能超出普通城市污水的污染程度。而清洁雨水则由于其相对较高的纯净度，对水质的影响较小。

最后，从对环境的影响来看，初期雨水如果直接排放到环境中，会给水环境造成一定程度的污染，对水生生态系统产生负面影响。而清洁雨水则可以作为一种可再生资源，经过收集和处理后，可以用于农业灌溉、工业用水和城市绿化等领域，有助于节约水资源，促进生态环境的可持续发展。

因此，在雨水利用和管理中，需要对初期雨水和清洁雨水进行区分和分类处理，以减少雨水对环境的影响，提高雨水资源的利用效率。