初期雨水和清洁雨水在多个方面存在显著的区别。

首先，从定义上看，初期雨水一般是指降雨初期时的雨水，特指地面10~15mm厚已形成地表径流的降水。这部分雨水由于降雨初期，溶解了空气中的大量酸性气体、汽车尾气、工厂废气等污染性气体，并且冲刷屋面、沥青混凝土道路等，导致其中含有大量的污染物质，污染程度较高，甚至可能超出普通城市污水的污染程度。

而清洁雨水，可以理解为相对较为纯净的雨水。雨水是大气中水蒸气凝结而成的水滴，源头主要来自海洋、湖泊、河流以及植被的蒸腾作用。相对于其他水源，雨水没有经过地面和水体的复杂循环过程，不含有大量的杂质和污染物。此外，雨水的pH值较低，呈酸性，这使得它具备一定的清洁能力。

其次，从对水质的影响来看，初期雨水由于含有大量的污染物质，如果直接排放到环境中，会给水环境造成一定程度的污染。而清洁雨水则由于其相对较高的纯净度，对水质的影响较小。

最后，从利用价值上看，初期雨水由于其高污染性，通常需要经过一系列的处理和净化步骤后才能进行再利用。而清洁雨水则具有更高的利用价值，例如可以用于农业灌溉、工业用水和城市绿化等。

综上所述，初期雨水和清洁雨水在定义、对水质的影响以及利用价值等方面都存在显著的区别。